2006年1月1日實施的新《公司法》規定，股東可以用實物、知識產權、土地使用權等可以用貨幣估價并可以依法轉讓的非貨幣財產作價出資，以專利權屬于知識產權的一種，以專利技術入股是法律明確肯定的形式。專利技術入股，是指以專利技術作為財產作價后，以出資入股的形式與其他形式的財產(如貨幣、實物、土地使用權等)相結合，按法定程序組建有限責任公司或股份有限公司的一種經營行為。新《公司法》對公司出資等諸多領域都進行了大量的修改，所以結合兩者的法律規定，在專利技術入股的操作中需要注意如下幾方面的問題：

1.以專利技術入股有兩個重要前提，即其一，此專利已獲得國家專利局頒發的專利證書，且仍處于專利有效期內；其二，以專利技術入股的人必須是是專利的合法權利人。

2、專利技術入股的形式，包括以專利所有權入股、以專利實施許可權入股，還有把專利申請權也視為專利技術作價入股。以上三種出資形式都是合法可行的，但實踐中對于以后兩種方式出資入股的，在一些問題的處理上還存在一定的法律障礙，比如對于專利獨占實施許可權的評估作價在實踐中不好確定以及出資義務的完成不容易確定等問題，所以，實踐中很少采用以后兩種方式入股的。在簽訂出資協議時，最好明確以專利技術入股的形式，為了減少糾紛，首當推以專利所有權入股。

3、在以專利技術入股時，還應當考慮到明確技術資料的交接和權利的移交、專利入股方的技術培訓和指導、后續改進成果的權屬和各方的違約責任等合同條款。

4、以專利所有權入股需完成以下出資手續方可認定出資無瑕疵，首先須對專利的價值進行評估，專利所有權的評估作價雖無統一的標準，但在實踐中可根據技術含量、壽命周期以及周期處于壽命的階段由專業的評估人士來評估。然后專利權人依據設立公司的合同和章程到專利局辦理專利權轉移于被投資的公司的登記和公告手續，工商登記機關憑專利權轉移的手續確定以專利技術入股的股東的完成股東出資的義務。

5、專利入股需要特別注意專利技術的可靠性。由于審批專利的審查員受專利局文獻存儲量的限制和工作疏忽等原因，給不具備專利條件的技術授予專利權的可能性是存在的，另外對于實用新型專利和外觀設計專利是不進行實質審查的，所以法律規定任何單位和個人都可以提出宣告專利無效的申請。一旦被宣告無效就不具備財產權的屬性，就不能作為入股的技術。因此在簽訂協議前對專利進行必要的審查檢索及在合同中約定入股專利被宣告無效后股東之間以及股東與公司之間的關系是非常必要的。

6.專利入股出資比例提高。我國原有的《公司法》規定無形資產的出資金額不能超過注冊資本的20%，被認定為高新技術企業對無形資產的比例為35%。所以過去以無形資產出資的不會成為絕對的控股股東，在公司治理中只能處于附屬地位。但根據新《公司法》規定知識產權的出資比例最高可達到70%，可成為絕對的控股股東。以專利技術出資的一方在簽訂出資協議時，應明確公司成立以后，自己的在治理公司方面的權利與義務，并明確獲取公司利潤的方式。因為《最高人民法院關于審理技術合同糾紛案件適用法律若干問題的解釋》規定，當事人以技術入股方式訂立聯營合同，但技術入股人不參與聯營體的經營管理，并且以保底條款形式約定聯營體或者聯營對方支付其技術價款或者使用費的，視為技術轉讓合同。如果以專利技術入股的一方不謹慎考慮此條款內容，可能會導致自己喪失股東的地位。

7、以專利技術入股，不用繳納營業稅。我國的《營業稅稅目注釋》規定，無形資產入股，參與接收投資方的利潤分配，共同承擔投資風險的行為，不征收營業稅。但轉讓該項股權時，應按營業稅的稅目征稅。

8、以專利技術入股還必須考慮到如何撤資或轉讓股權的問題。以技術入股，出資額是經過專業人士評估出來的確定價格，日后以技術入股一方如想轉讓股權或撤資，如何確定該股權轉讓的價格將會是很重要的問題。建議在制作公司章程時，就明確約定撤股或股權轉讓時，如何計算股權轉讓的價格，避免日后糾紛。